Следует быть осторожным при оценке спектров твердых веществ, существующих в виде нескольких кристаллических модификаций, так как различные кристаллические формы имеют разные инфракрасные спектры. В некоторых случаях существует также возможность физических или химических изменений при растирании с парафиновым маслом или со щелочным галоидом.
Трудности, связанные с полиморфизмом, могут быть преодолены приготовлением растворов стандарта и испытуемого вещества в подходящем растворителе. Затем растворитель удаляют выпариванием, готовят для каждого остатка новые диски, которые затем подвергают вторичному исследованию.
Методика определений со взвесями или дисперсиями в щелочном галоиде чаще всего используется для текущего фармацевтического анализа.
При изучении структур, однако, рекомендуют проводить измерения в растворах.
Инфракрасные спектрофотометры регистрируют на бумаге процент пропускания или поглощение по отношению к волновому числу или длине волны. Техника измерений практически не отличается от подобной в ультрафиолетовой области.
Двухлучевые приборы обеспечивают показания, свободные от влияния паров воды и поглощения углекислого газа, и дают возможность компенсации поглощения растворителя при работе с растворами.
При дифференциальных измерениях можно получить спектр отдельных полос поглощения, менее заметных при обычных определениях. Для этого основной компонент по аналогии с измерениями в ультрафиолетовой области помещают в контрольную кювету и в результате компенсации основных показателей спектра получают спектр отдельных вторичных функциональных групп.
Методика дифференциальных определений может быть применена для испытания на чистоту, так как при компенсации основных компонентов любая примесь при условии, что в контрольной кювете находится более очищенное вещество, будет заметна на спектре. Таким образом, можно обнаружить и количественно измерить до 0,05% примесей.
Тот же способ можно применить для количественного определения лекарственных форм, из которых трудно извлечь действующее вещество. Например, при анализе масляных растворов, применяя в качестве контроля масло, можно получить и измерить полосу поглощения, характерную для исследуемого вещества. Однако этот метод имеет ограниченную ценность для фармакопейного анализа вследствие необходимости иметь вещество определенного качества для сравнения.
Трудности, возникающие при дифференциальных измерениях, обусловлены тем, что при сильном поглощении в обоих лучах (изучение структурных особенностей) этот метод может быть исключительно полезным.